本发明涉及一种多耐性高产酒精酵母突变株TT31及其筛选方法，利用基因组改组技术筛选耐高温、耐酒精、耐酸的高产酒精酵母诱变株的方法，步骤如下：

对三株酵母菌株进行紫外线诱变，采用TTC法一级筛选、杜氏管发酵法二级筛选、摇瓶发酵法三级筛选，选出具有三种耐性且酒精产量明显提高的10株酵母突变株，对其进行原生质体制备，经过三轮的基因组改组，最终得到了对温度、酒精和酸耐性都有较大提高的酵母突变菌株TT31，该突变株在35℃条件下，以蔗糖为碳源进行酒精发酵72h，酒精产量达到了1019g/L。