本发明涉及长柱金丝桃药材HPLC指纹图谱的建立方法,包括供试品溶液的制备、色谱条件的选择,通过对10批次长柱金丝桃药材HPLC指纹图谱的对比,确定其共有指纹特征峰,得到长柱金丝桃药材的标准指纹图谱。本发明长柱金丝桃药材标准指纹图谱将长柱金丝桃药材作为一个整体对待,通过比较其共有特征峰可以找出不同药材之间的细微差异,因此适于对长柱金丝桃药材的真伪的鉴别和质量控制,保证了长柱金丝桃药材质量的稳定、均一和可控。