本发明属于数值模拟技术领域,公开一种预测不同气候变化影响浅层地下水海水入侵的方法,包括以下步骤：(1)建立研究区水文地质概念,确定源汇项、地下水流场及盐度场初始条件；(2)利用地下水模型GMS建立研究区的地下水数值模型和地下水溶质运移模型并进行识别验证；(3)通过Cmhyd降尺度后的气候数据输入到地下水溶质运移模型中进行模拟,得到预测的地下水盐度分布及动态变化,分析不同气候因素对地下水海水入侵的影响。本发明考虑了全球变暖的影响,降水和温度随时间变化而不是一个固定值,可以更好地预测未来气候；在进行浅层地下水海水入侵模拟时,变化的降水量和温度也可以更全面理解气候变化如何影响浅层地下水海水入侵程度。