本发明提供了一种点云数据配准方法、系统及电子设备,涉及点云数据配准领域,该方法对工业零件的点云数据进行数据精简处理从而降低点云密度；进而分割并去除点云数据中的背景点云降低噪声点,通过采用改进的特征匹配进行点云的粗配准,随后采用最近邻迭代进行点云的精配准,最终得到工业零件模板点云与目标工件点云的位姿变换关系,从而精确的将工业零件从点云数据场景中进行分离；该方法对工业零件的匹配精度高,分离效果好,解决了现有技术中存在的点云数据配准效果差的问题。