本发明提供了一种多糖分离纯化过程中脱除蛋白质的新方法,步骤是：先配制成一定质量百分数的多糖溶液；然后在多糖溶液中加入不同氧化度的双醛纤维素,控制料液比(g/mL),反应温度,调节pH值,在规定温度下反应一定时间,待反应完毕,经冷却、离心分离,取上清液,按照上述操作重复数次,得到脱除蛋白后的多糖溶液。本方法为脱蛋白方法提供了新思路,且工艺简单,易于操作；同时原料纤维素具有资源丰富、环境友好等优点,是一种绿色环保的脱蛋白方法,有利于粗多糖的规模化分离纯化。