本发明涉及一种聚季铵盐离子液体酶反应器的制备方法,步骤如下：在乙腈溶液中加入三乙胺,随后逐滴加入4-乙烯基苄氯,搅拌加入乙酸乙酯,抽滤、干燥；将功能单体溶于甲醇中,然后加入交联剂、引发剂；水浴50℃～80℃引发聚合、洗涤、真空干燥；在Tris-HCl缓冲液中结合蛋白酶,结合完成后的溶液进行离心,离心后的材料用去离子水洗涤后,即得聚季铵盐离子液体酶反应器。本方法制得的酶反应器生物相容性好,分散性好,酶解效率高,提高酶的利用效率,性能稳定,可以实现重复利用,可以重复利用至少三次,在4℃的环境中放置60天后,仍能用于对蛋白的酶解。