本发明提供一种低产正丙醇的基因工程菌,所述基因工程菌是由酿酒酵母将高丝氨酸脱氢酶基因THR6全部缺失得到。其中THR6基因编码的高丝氨酸脱氢酶能够催化苏氨酸生物合成途径第三步的二聚体酶,该酶在酿酒酵母苏氨酸的合成途径中起关键作用。苏氨酸可以被转化生成2-酮丁酸。2-酮丁酸是酿酒酵母合成正丙醇的必要前体物质,直接影响着正丙醇的产量。本发明所述基因工程菌应用于液态发酵法生产白酒中。