本发明涉及一种利用转谷氨酰胺酶及壳聚糖制备铁蛋白-壳聚糖复合物的方法,步骤如下：所述方法以红豆提取铁蛋白为原料,利用转谷氨酰胺酶的催化作用,使壳聚糖结合于铁蛋白上,通过凝胶过滤方法分离有效的结合组分,即得铁蛋白-壳聚糖复合物,得到的铁蛋白-壳聚糖复合物具有相较于铁蛋白更高的稳定性。本方法利用转谷氨酰胺酶催化壳聚糖共价结合于铁蛋白外壳上,提高铁蛋白的热稳定性及肠胃消化稳定性,进而提高铁蛋白的生物利用度和补铁效率,该方法制得的铁蛋白-壳聚糖复合物能够应用在食品添加剂、饲料、保健食品等行业中。