本发明提供一种复合发酵饮料及其制备方法,涉及食品加工领域。该复合发酵饮料的制备方法包括以下步骤：对桑叶进行浸提,得到桑叶浸提液,对燕麦和荞麦籽粒进行粉碎,得到燕麦粉末和荞麦粉末；将燕麦粉末、荞麦粉末和桑叶浸提液混合,通过研磨工艺充分匀浆,得到匀浆液；将匀浆液加热糊化,得到糊化液,向糊化液中加入淀粉酶和糖化酶进行酶解,得到酶解液；将酶解液进行灭酶灭菌处理,冷却,先接入酵母菌进行单独发酵,再接入乳酸菌进行共同发酵,得到发酵液；对发酵液进行灭菌,得到灭菌液；向灭菌液中添加辅料进行调配。本发明同时提升了谷物饮料的风味和口感,最大限度地提高了其营养价值,还具有一定的降血糖作用,增加了谷物饮料的功效性。