本发明涉及一种毕赤酵母定点DSB系统,构建步骤如下：构建site-I-SceI-KanMX转化盒,利用诱导型启动子,电转化野生毕赤酵母GS115菌株,即得毕赤酵母定点DSB系统。本发明以毕赤酵母为载体,利用归位内切酶I-SceI建立的定点DSB诱导系统,可以提高转化效率,同时细胞对其修复应答产生了Aneuploidy,与人肿瘤细胞中的Aneuploidy相似,可以作为一个研究定点DSB导致的Aneuploidy模型。