本发明属于基因工程和酶工程领域,涉及工业微生物的育种,特别涉及一种用于生产蛋白酶的底盘菌株及其构建方法。本发明提供了一种解淀粉芽孢杆菌基因工程菌,该基因工程菌不表达解淀粉芽孢杆菌基因组上的六种胞外蛋白酶基因aprE,bpr,vpr,mpr,nprE,epr,胞外多糖基因簇eps,聚谷氨酸基因簇pgs,sacB基因,和双组分感觉组氨酸激酶sasA基因。并且利用所述底盘菌株实现异源蛋白酶的高效表达,所述蛋白酶选自氨肽酶或碱性蛋白酶。