本发明公开了一种充分利用孵化水体的卤虫卵高密度孵化方法,其特征在于：分两个阶段进行卤虫卵的孵化；其中第一个孵化阶段的卤虫卵孵化密度不低于5g/L,孵化时间不少于3h；第二个孵化阶段的卤虫卵孵化密度低于第一个孵化阶段且第二个孵化阶段的孵化时间长于第一个孵化阶段。本发明的有益效果在于：在保证较高孵化率的基础上实现了卤虫卵的高密度孵化；提高孵化池/容器及水体的利用率,从而克服现有孵化方式水体利用率低、水质差的问题。此外,本发明孵化方法适用范围广,可用于卤虫卵的常规孵化、脱壳孵化和添加孵化强化剂孵化。