本发明涉及一种碱性果胶酶基因工程菌培养条件的优化方法,步骤如下：(1)采用单因素实验对碱性果胶酶基因工程菌的发酵培养基组成进行优化,得到初步优化的发酵培养基；(2)响应面方法对目标菌种培养基进行优化,得到目标菌种培养基；(3)采用后优化培养基,对目标菌种进行发酵培养条件优化,得到优化培养条件。本发明摸索到一套最优的发酵培养条件,使工程菌发酵所产生的酶活达到758.7825U/ml,比原始野生型菌株产碱性果胶酶活性提高了50倍,比LB培养基发酵基因工程菌产碱性果胶的酶活力提高了3倍,对提高工业酶的市场竞争力有着非常重要的意义。