本发明属于生物工程技术领域,特别涉及到一种苯丙氨酸脱氢酶和甲酸脱氢酶的自组装方法和应用。本发明将拉链蛋白通过刚性连接子连接到PDH和FDH的N端或C端,分别得到带拉链的PDH和FDH,将带拉链的PDH和FDH进行混合制备PDH和FDH自组装蛋白。所得自组装蛋白具有成本低、易于操作的优点,并且提高了NADH的循环速度,自组装酶的温度稳定性和和底物转化速度相对游离酶均有显著提高,在催化酮基胺化反应中,特别是沙格列汀手性药物中间体的工业化生产中具有极高的应用价值。