本发明公开了一种适用于木葡糖酸醋杆菌的双质粒系统,涉及基因编辑系统在该菌株中的过表达。本双质粒系统包括质粒1和质粒2,质粒1的名称是pSERED,质粒2的名称是pCas9SG。本发明能够使pSERED和pCas9SG两种质粒在木葡糖酸醋杆菌中稳定表达。所述方法对于木葡糖酸醋杆菌的基因功能研究,细菌纤维素代谢机制解析,以及细菌纤维素结构的调控方面具有广阔的应用前景。