本发明涉及一种实现玉米芯残渣中糖类与木素组分清洁分离的方法,步骤如下：对玉米芯残渣分别进行化学法预处理和机械法预处理；生物酶处理；分离生物酶水解液与残渣；抽提处理；过滤；旋转蒸发；过滤、洗涤、冷冻干燥、洗涤、真空干燥,最终获得纯化后的木素。本发明方法充分实现了玉米芯残渣这种农作物废弃物的有效利用,不仅可以有效利用农业废弃物资源,也减轻了对环境保护的压力,是利国利民、符合国家可持续发展战略和迫在眉睫的方法,对我国国民经济的发展、清洁生产以及环境保护都具有重要意义。