本发明涉及一种通过解脂耶氏酵母过氧化物酶体区室化工程合成α-红没药烯的工程菌及方法,属于分子生物学技术领域。本发明首次在严格好氧微生物解脂耶氏酵母中将法尼烯基合成途径过表达并定位至过氧化物酶体合成α-红没药烯。本发明的工程菌株Polg P9能够利用含厨房废油的培养基高效合成α-红没药烯,摇瓶最高产量为2550.7mg/L,在发酵罐中通过分批补料的方式获得15.5g/Lα-红没药烯,是迄今为止报道的微生物细胞工厂菌株中的最高产量。为今后开展解脂耶氏酵母等微生物细胞工厂合成红没药烯或其他萜烯类化合物提供了有价值的参考。