本发明属于生物工程技术领域,涉及工业微生物的育种,特别涉及一种生产碱性蛋白酶的底盘菌株及其构建方法与用途。本发明提供了一种地衣芽孢杆菌基因工程菌株,该基因工程菌株不表达地衣芽孢杆菌基因组上的chiAB,PulA,AmyA,spo0A,sigF,eps,pgs,lchAC以及核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示的SacB基因,同时过表达碱性蛋白酶基因aprE。本发明从实验和生产中的实际情况出发,通过对基因工程宿主的改造简化,最终获得了一种能够高产碱性蛋白酶的底盘菌株,并且为构建蛋白酶高产底盘菌株提供了新的思路。