本发明属于食品加工领域,具体涉及一种葡甘低聚糖酶在新鲜魔芋生产魔芋寡糖方面的应用。包括下述步骤：1)：新鲜魔芋去皮加水打浆,制得新鲜魔芋浆料,其中料液质量比为1：5#1：20；2)：步骤1)得到的新鲜魔芋浆料中加入葡甘低聚糖酶；葡甘低聚糖酶液与新鲜魔芋浆料的质量比为1:100；葡甘低聚糖酶以解淀粉芽孢杆菌为培养菌株,在发酵培养基中培养；3)：经步骤2)得到的混合物搅拌均匀后进行水解；水解后的魔芋浆进行离心分离收集上清液；将得到的上清液进行灭菌、脱色以及脱嗅处理,最后进行喷雾干燥,即可得到魔芋葡甘低聚糖。本发明得到葡甘低聚糖产物具有分子量极为集中的分布特征,为提高该低聚糖的营养功能提供了保证。