本发明属于生物大分子荧光标记领域,特别涉及一种荧光标记阿拉伯木聚糖的方法。荧光标记阿拉伯木聚糖的方法主要包括两个步骤：(1)将阿拉伯木聚糖溶于PBS溶液中,在搅拌条件下依次加入酪胺和氰基硼氢化钠,冻干得到阿拉伯木聚糖-酪胺复合物；(2)将复合物溶于蒸馏水中,加入异硫氰酸荧光素(FITC),阿拉伯木聚糖即接上荧光基团。通过所述方法使不带有特殊基团的阿拉伯木聚糖转变为易于检测的带有荧光的多糖,并且所述标记方法对于阿拉伯木聚糖的结构无显著影响,对于研究阿拉伯木聚糖及其他多糖在食品加工、消化等过程中的定向追踪及药理活性机制等研究有一定参考价值。本发明的荧光标记阿拉伯木聚糖的方法具有反应条件温和、操作简单、稳定时间长等特点。