本发明涉及一种利用胆碱类低共熔溶剂提高果糖基转移酶催化效率和稳定性的方法,包括：以氯化胆碱低共熔溶剂和缓冲液的混合溶液作为催化体系,以果糖基转移酶为催化剂转化底物蔗糖为低聚果糖。结果发现,相较于原缓冲液体系,低共熔溶剂体系会使果糖基转移酶酶活及转化率提高10％以上。而且,相较于原缓冲液体系,低共熔溶剂体系会使果糖基转移酶储存稳定性提高40％以上。