本发明涉及一种通过微生物转化合成丁二胺的方法,所述方法利用微生物重组菌株表达鸟氨酸脱羧酶基因,将底物鸟氨酸转化成丁二胺,得丁二胺。本发明方法通过构建大肠杆菌重组菌株分泌表达鸟氨酸脱羧酶至大肠杆菌周质腔中,然后向发酵液中投入一定浓度的底物鸟氨酸,周质腔中的鸟氨酸脱羧酶将鸟氨酸转化为丁二胺,解决了丁二胺向细胞外转运的难题,降低了生产成本,经济环保,操作简单方便,提高了丁二胺的产量。